υφιστάμενα αιολικά πάρκα, αλλά κυρίως με έργα που βρίσκονται σε διάφορα στάδια αδειοδότησης σύμφωνα με τα δεδομένα της ΡΑΑΕΥ.
Ειδικότερα, η απειλή ή πίεση που σχετίζεται με σχεδιαζόμενα ή σε λειτουργία ΑΣΠΗΕ (Αιολικοί Σταθμοί Παραγωγής Ηλεκτρικής Ενέργειας) που έχουν καταγραφεί στην περιοχή της συγκεκριμένης ΕΠΜ (Κάσος, Κάρπαθος, Ρόδος, Κως και όλα τα γύρω νησιά) φαίνεται, σύμφωνα με τους μελετητές, να επηρεάζει άμεσα τόσο τους οικοτόπους λόγω υποβάθμισής ή απώλειάς τους, όσο και τα είδη πανίδας και χλωρίδας της περιοχής λόγω απώλειας ή κατακερματισμού τους.
Ειδικότερα, στις Ζώνες Διατήρησης της σύνθετης περιοχής προστασίας βιοποικιλότητας οι οποίες αφορούν σε εσωτερικά ημιορεινά και παράκτια τμήματα της Ρόδου, θα επιτρέπονται υπό όρους, οι οποίοι θα εξειδικεύονται με το Σχέδιο Διαχείρισης, λαμβάνοντας υπόψη τις μελέτες φέρουσας ικανότητας με βάση τις τοπικές ανάγκες για ενεργειακή αυτάρκεια και μόνο από ηλιακή ενέργεια, ήτοι από φωτοβολταϊκά.
Το ίδιο προτείνεται και για τις Ζώνες Διατήρησης της σύνθετης περιοχής προστασίας βιοποικιλότητας στις εσωτερικές και παράκτιες περιοχές της Καρπάθου. Όσο για την Κω, θα επιτρέπονται στις συγκεκριμένες ζώνες μόνο έργα ηλιακής ενέργειας, με τους ίδιους όρους που θα εξειδικεύονται με Σχέδιο Διαχείρισης βάσει μελετών φέρουσας ικανότητας που περιγράφονται με βάση τις τοπικές ανάγκες για ενεργειακή αυτάρκεια.
Όσο για τις χωροθετήσεις ΑΠΕ σε αγροτικές εκτάσεις στις Ζώνες Βιώσιμης Διαχείρισης Φυσικών Πόρων των Natura, προβλέπεται ότι στη Ρόδο θα επιτρέπεται με όρους που θα εξειδικεύονται στο Σχέδιο Διαχείρισης. Μάλιστα, γίνεται ειδική αναφορά στην Τήλο επισημαίνοντας ότι θα επιτρέπεται η χρήση της υφιστάμενης ανεμογεννήτριας και του υφιστάμενου φωτοβολταϊκού πάρκου στην Τήλο.
Σε αγροτικές εκτάσεις της Κω, εντός των συγκεκριμένων ζωνών προστασίας, θα επιτρέπονται μόνο φωτοβολταϊκά ενώ στις αντίστοιχες της Καρπάθου μόνο εγκαταστάσεις μεταφοράς ηλεκτρικής ενέργειας, φυσικού αερίου, ύδρευσης και τηλεπικοινωνιών. Όσον αφορά σε ΑΠΕ σε αγροτική γη εντός Ζωνών Βιώσιμης Διαχείρισης της Καρπάθου θα επιτρέπονται σε ορισμένα σημεία με όρους που θα εξειδικεύονται στο Σχέδιο Διαχείρισης ενώ στις υπόλοιπες θα επιτρέπονται μόνο φωτοβολταϊκά.
Σε μεικτές οικιστικές και αγροτικές εκτάσεις της Ρόδου επίσης θα επιτρέπεται ΑΠΕ υπό όρους που θα εξειδικεύονται στο Σχέδιο Διαχείρισης ενώ στις αντίστοιχες της Κω μόνο φωτοβολταϊκα. Εκεί θα επιτρέπονται και χωροθετήσεις εγκαταστάσεων παραγωγής, αποθήκευσης και μεταφοράς ηλεκτρικής ενέργειας και φυσικού αερίου, εφόσον δεν είναι δυνατή εναλλακτική όδευση εκτός ζώνης. Αντίστοιχες εγκαταστάσεις θα επιτρέπονται και στο Αιολικό Πάρκο όρους Δίκαιος Κω.
Φωτοβολταϊκά θα επιτρέπονται και σε αμμώδεις ακτές εντός Ζωνών Βιώσιμης Διαχείρισης με τους όρους και πάλι να εξειδικεύονται στο Σχέδιο Διαχείρισης, βάσει και των τοπικών αναγκών για ενεργειακή αυτάρκεια. Ακόμη, σε εκτάσεις με υποδομές των Ζωνών Βιώσιμης Διαχείρισης Φυσικών Πόρων στο Καστελόριζο θα χωροθετούνται φωτοβολταϊκά για την παραγωγή ηλεκτρικής ενέργειας.