Αρχικά θα πρέπει να αναφέρουμε ότι ο ιδιοκτήτης του ακινήτου (ωφελούμενος του έργου) θα πρέπει να αποφασίσει εάν θα διαχειριστεί αυτός τα απόβλητα ή θα τα αναθέσει σε ανάδοχο. Η απόφαση αυτή θα πρέπει να καταγραφεί στο «Έντυπο Καταγραφής Παρεμβάσεων – Ολοκλήρωσης Έργου». Εφόσον ο κατασκευαστής κουφωμάτων αναλάβει να συλλέξει τα απόβλητα και να τα διαχειριστεί αυτός, τότε οφείλει να τα συγκεντρώσει και στη συνέχεια να τα διαθέσει σε εταιρεία η οποία είναι κάτοχος άδειας συλλογής/μεταφοράς Α.Ε.Κ.Κ.
Στον οδηγό του προγράμματος, καθώς και στο Παράρτημα Χ του οδηγού, δεν αναφέρεται ότι θα πρέπει για κάθε έργο να υπάρχει έντυπο διαχείρισης των αποβλήτων το οποίο να κατατίθεται κατά την ολοκλήρωση του προγράμματος.